精子畸形症可能也是精液发黄的原因之一。精液中畸形精子超过20%，畸形精子包括头，体、尾的形态异常，或头体混合畸形。精液发黄的原因中还有一部分是精子凝集症。由于存在精子抗体，导致精子自身凝集，通过精子凝集试验和性交后试验均见精子凝集者为精子凝集症，精液发黄的原因须与精液不液化症相鉴别。
精子发黄的原因
精液发黄，有可能是长时间没有性生活，禁欲时间较长导致的，也可能是生殖器发炎如前列腺炎等；或精液内含有尿液。而从病理上来说，精子发黄的原因如下：
1、精子凝集症是引起精子发黄的原因之一
因为精囊发生不液化的现象。就会产生大量的精子抗体，导致精子出现过多凝结，这样长久下去，精子就会出现发黄现象。
2、生殖感染
男性出现前列腺炎、精囊炎，也会引起精子发黄的现象，需要及时医治。
3、精子畸形症引起精子发黄
精液中畸形精子超过20%，畸形精子包括头，体、尾的形态异常，或头体混合畸形。