药粉除尘器的除尘效率是衡量除尘器性能最基本的参数，它表示除尘器处理含尘气体的能力，它与除尘布袋的工作状态有关，并受粉尘性质、阻力、粉尘层厚度、滤料材质、过滤风速以及清灰方式等诸多因素的影响。
除尘器的在不同工作状态下对除尘效率的影响：
同一种除尘布袋在不同工作状态下的分级效率是不同的，清洁除尘的除尘效率最低，药粉除尘器积灰后的除尘效率最高，清灰后除尘的收尘效率有所降低。可见除尘器起主要收尘作用的是除尘布袋表面的粉尘层，通常称为二次过滤层，而除尘器仅起支撑粉尘层的作用。所以清灰的强度要适当，应保留一定厚度的粉尘层，以免除尘效率下降。
粉尘粒径对布袋除尘器除尘效率的影响：
药粉除尘器对0.2—0.4μm的粒径，普通除尘布袋在三种工作状态下的收尘效率均最低，因为这一范围的尘粒处在袋式除尘器作用原理
"拦截作用"和"扩散作用"的下限，所以在0.2-0.4μm范围内的粉尘是最难捕集的。
药粉除尘器结构及粉尘负荷对除尘器除尘效率的影响：
药粉除尘器表面沉积的粉尘负荷大小也与布袋除尘器的除尘效率有直接关系数。
从另一方面来说导致药粉除尘器除尘效率降低的最常见的因素之一就是清灰系统失效：即喷吹进滤袋的压缩气清灰力量不能有效地把粘附在滤料上的灰尘打掉，使除尘器的阻力升高，滤料糊袋。而令清灰系统失效的最主要原因，就是电磁脉冲阀的质量问题。
